Secretariatul Consiliului ONG este asigurat de organizaţia neguvernamentală Platforma Pentru Cetățenie Activă și Parteneriat pentru Drepturile Omului, selectată de Consiliu în bază de concurs, după următoarele criterii:
a) Organizaţia are o reputaţie bună şi dispune de resurse (umane, tehnice, financiare) pentru asigurarea lucrărilor de secretariat;
b) Organizaţia are rapoarte anuale de activitate şi financiare şi rapoarte de audit.
Secretariatul asigură:
• Organizarea şedinţelor Consiliului;
• Întocmirea şi păstrarea proceselor-verbale;
• Redactarea deciziilor, hotărârilor şi declaraţiilor adoptate de Consiliu;
• Multiplicarea materialelor necesare pentru şedinţele Consiliului;
• Difuzarea informaţiei oficiale din numele Consiliului;
Activitatea Secretariatului este monitorizată şi evaluată de Consiliu şi Preşedinte. În cazul încălcării prevederilor Regulamentului, depăşirii sau neexecutării atribuţiilor, Consiliul este în drept să selecteze o altă organizaţie, în bază de concurs.
Secretariatul păstrează documentele oficiale ale Consiliului până la expirarea mandatului, după care le va preda organizaţiei care va asigura lucrările de secretariat în noul format, după următoarea ediţie a Forumului ONG.